آيتالله مقتدايي با رأي اعضاي شوراي عالي حوزه به مدت يكسال به عنوان دبير جديد شوراي عالي انتخاب و معرفي شد.
انتخابات سومين سال از دوره ششم شوراي عالي حوزههاي علميه برگزار و طي آن آيتالله مرتضي مقتدايي به عنوان دبير انتخاب شد. حجت الاسلام نواب مسئول دبيرخانه شوراي عالي حوزههاي علميه در گفتوگو با رسا، تصريح كرد: شوراي عالي هر ساله براي دبيران اول و دوم و هيئت رئيسه انتخابات دارند. وي بيان كرد: روال قانوني بر اين است كه انتخابات براي دبير اول، دبير دوم و امناي مالي انجام ميشود و در اين دوره( سومين سال از دوره ششم) آيتالله مقتدايي به عنوان دبير اول انتخاب شدند.
حجت الاسلام نواب با بيان اينكه آيتالله استادي با وجود اصرارهاي مكرر براي دبيري كانديدا نشدند، گفت: با كانديدا نشدن آيتالله استادي، اعضاي شوراي عالي آيتالله مقتدايي را كه پيش از اين به عنوان دبير دوم ايفاي مسئوليت ميكرد به عنوان دبير اول و آيتالله سيد محمد غروي را به عنوان دبير دوم شوراي عالي انتخاب كردند. وي بيان كرد: از ابتداي دوره ششم شوراي عالي حوزههاي علميه، آيتالله استادي با رأي اعضا مسئوليت دبير اولي شورا را عهده دار بودند و البته در حال حاضر نيز به عنوان عضو فعال هستند و در جلسات حضور مييابند. مسئول دبيرخانه شوراي عالي حوزه درباره دلايل كنارهگيري آيتالله استادي نيز گفت: ايشان در جلسه چيزي در اين باره بيان نكردند، اما به نظر ميرسد كه كسالت، خستگي و بالا رفتن سن علت انصراف ايشان باشد. حجت الاسلام نواب همچنين از تمديد رياست آيتالله بوشهري در مركز مديريت حوزههاي علميه به مدت دو سال ديگر از سوي شوراي عالي حوزههاي علميه خبر داد. آيتالله مرتضي مقتدايي همچنين نايب رئيسي جامعه مدرسين حوزه علميه قم را عهده دار است و پيش از آيتالله حسيني بوشهري مديريت حوزههاي علميه سراسر كشور را بر عهده داشت.