حجتالاسلام والمسلمین سیدمحمود مرعشی نجفی، فرزند اندیشمند و نسخه پژوه زندهیاد آیتاللهالعظمی سیدشهاب الدین مرعشی نجفی و ریاست دفتر آن بزرگ است. او از این بابت، از پدر ارجمند خویش خاطراتی شنیدنی دارد که بخشی از آن معطوف به کارنامه سیاسی آن مرجع نامور است. حجتالاسلام والمسلمین سیدمحمود مرعشی نجفی، فرزند اندیشمند و نسخه پژوه زندهیاد آیتاللهالعظمی سیدشهاب الدین مرعشی نجفی و ریاست دفتر آن بزرگ است. او از این بابت، از پدر ارجمند خویش خاطراتی شنیدنی دارد که بخشی از آن معطوف به کارنامه سیاسی آن مرجع نامور است. وی در واگویه بخشی از این یادمانها، به مراودات شهید نواب صفوی و اعضای جمعیت فدائیان اسلام با پدر اشارت میبرد و میگوید: «فدائیان اسلام در قم با مرحوم آیتالله آسید محمدتقی خوانساری - از آیات ثلاث- خیلی ارتباط داشتند و در مرتبه بعدی، با مرحوم ابوی در ارتباط بودند. نامههای زیادی از سوی اعضای فدائیان اسلام از جمله مرحوم نواب صفوی و مرحوم واحدی داشتیم که بعضی از آنها موجود است و چاپ شده است. یادم است مدت دو ماه، مرحوم خلیل طهماسبی مخفیانه در منزل ما بود، چون خیلی دنبالش بودند. والده برای ایشان غذا درست میکردند و نمیگذاشتند هیچ کس بفهمد. نکته دیگر در ارتباط با فدائیان این است که مرحوم نواب صفوی را ابتدا در مسگرآباد دفن کردند، ولی عدهای آمدند و از ابوی برای نبش قبر و انتقال ایشان به قم کسب تکلیف کردند. مرحوم والد هم مشروط بر اینکه جسد به همراه خاک اطراف آن برداشته شود و به هم نخورد، اجازه دادند. آنها نیز همین کار را کردند و ابوی ما ساعت یک بعد از نیمه شب رفتند و مجدداً بر او نماز میت خواندند و در قبرستان وادی السلام قم دفن کردند. هیچکس این را نمیدانست. غرض اینکه خیلی پدر ما به اینها علاقه داشت...».
آیتاللهالعظمی مرعشی نجفی در حمایت از نهضت امام خمینی، حضور و مشارکتی نمایان داشت و اسناد موجود نیز شاهدی بر این مدعاست. استاد سیدمحمود مرعشی در این باره نیز آورده است: «در جریان دستگیری حضرت امام در ۱۵ خرداد، مرحوم ابوی به نشانه اعتراض بیانیه دادند. تا آن روز، هیچ کس غیر از ایشان اطلاعیه نداده بود. من با یکی از دوستان این بیانیه را کپی کردیم. یادم است نوزادی داشتیم که فرزند اول ما بود. تعداد زیادی از این بیانیه را در قنداق بچه گذاشتیم و از طریق خانواده و همشیره، بیانیهها را به مرحوم طیب در تهران رساندیم. وقتی هم حضرت امام را آزاد کردند، مرحوم ابوی تا سه روز پس از آزادی، هر روز خدمت ایشان میرفتند و این رفتن ایشان معنایش این بود که ما با ایشان هستیم و راه و روش ایشان را قبول داریم. در جریان تحصن علمای طراز اول کشور در تهران هم ایشان حضور داشتند. البته بعد از چهار ماه به زور، آقایان را به شهرهای خود بازگرداندند. مرحوم ابوی ما را نیز با بیاحترامی تمام به قم برگرداندند...».
مرزبندی با رفتارهای ناسازگارانه و حتی ستیزهجویانه آیتالله سیدکاظم شریعتمداری با نظام اسلامی، در زمره رویکردهای آیتالله مرعشی نجفی به شمار میرود. فرزند آیتالله در این باره نیز روایتی به ترتیب پی آمده دارد: «یادم است که یکبار، جلسه مراجع در منزل مرحوم آیتالله گلپایگانی تشکیل شد. من صدای امام را میشنیدم که میفرمود: آقای شریعتمدار! من الان دارم کاری میکنم که آبروی شما نرود، والله دیگر از دست من هم خارج میشود، مردم دیگر اجازه نمیدهند، این نهضت مال همه ماست... خاطره دیگری که در ذهن دارم، مربوط به اعلام راهپیمایی است که آقای شریعتمداری مصاحبه کردند و گفتند که این راهپیمایی بدون اطلاع مراجع است. من این موضوع را به ابوی گفتم. ایشان فرمودند: اینجور نیست و ما اطلاع داریم، شما برو تکذیب کن و من این کار را انجام دادم. تکذیبیه ما در بالای صفحه روزنامه اطلاعات چاپ شد...».