بر اين اساس در تاريخ دوم آذرماه 1367 بنيانگذار کبير جمهوري اسلامي ايران حضرت امام خميني(ره) طي پيامي عارفانه، روشنگرانه و توام با آيندهنگري دقيق كه منبعث از بينش عميق ايشان بود، فرمان تشكيل بسيج دانشجو و طلبه را به عنوان يكي از ضروريترين تشكلها صادر كردند و ضمن درخواست دفاع از انقلاب و اسلام در مراكز دانشگاهي و حوزوي، خواستار پاسداري از اصول تغييرناپذير «نه شرقي و نه غربي» شدند و ضمن دعوت به اتحاد و يگانگي حوزه و دانشگاه، چشمانداز ايجاد حكومت بزرگ اسلامي و فتح جهان توسط اسلام را فراروي مشتاقان و رهروان اسلام ناب محمدي(ص) در دانشگاهها قرار دادند.
بسيج دانشجويي طي 28 سال گذشته در دانشگاهها در عرصههاي مختلف: علمي، آموزشي، تربيتي و فرهنگي با برنامههاي متنوعي در دانشگاهها و در کنار ديگر تشکلها نقشآفريني نموده است و با اصولي نظير: مطالبهگري، جريانسازي، گفتمانسازي، تبيين و روشنگري، ارزشمداري، استکبارستيزي، بصيرتبخشي، اعتدال، قانونمداري، نخبهپروري، تعامل سازنده، کادرسازي، فراگيري، کلنگري، نگرش علمي، آزادانديشي، روحيه جهادي و انقلابي، خودباوري، وحدت، فراجناحي، کارآمدي، هويتسازي، نوآوري، شبکهسازي، چابکي، پايداري، حکمت، واقعگرايي، ظرفيتسازي، کيفيت و تعالي، مشارکت، انعطافپذيري، در چهار حوزه علم، سياست، دين و خدمت در درون دانشگاه و جامعه نقش مؤثري را ايفا نموده و با تلاشهاي شبانهروزي خود در سنگر علم و دانش در محيط مقدس دانشگاه نسبت به کادرسازي براي آينده انقلاب و کمک به حل چالشهاي پيشروي نظام مقدس جمهوري اسلامي ايران با روحيه جهادي و انقلابي با فعاليتهاي متنوع علمي، آموزشي، ورزشي و فرهنگي به کار خود ادامه ميدهدتا با روحيه خودباوري و جهادي و انقلابي متاثر از شهداي جهاد علمي به جنبش نرمافزاري، تغيير در علوم انساني، توليد علم و تحقق دانشگاه اسلامي با نقشآفريني اعضا و عناصر خود در رشتههاي مختلف دانشگاهي، تحت تدابير و منويات مقام معظم رهبري بتواند به رسالتها و اهداف خود نظير: جلوگيري از نفوذ ايادي استکبار در دانشگاه، تلاش براي ايجاد حکومت بزرگ اسلامي در جهان، ترسيم چارچوبهاي اصيل اسلام ناب محمدي در دانشگاهها، اتحاد و يگانگي حوزه و دانشگاه، پاسداري از اصول تغييرناپذير نه شرقي و نه غربي، حل مسائل اعتقادي بسيجيان و دفاع از اسلام و انقلاب با تمام توان در دانشگاهها نائل آيد.