شهید آیتالله محمد صدوقی در سال ۱۳۲۷ﻫ. ق، در خانوادهای روحانی در یزد به دنیا آمد. پدرش آقا میرزا ابوطالب، از روحانیون برجسته استان یزد بود و امامت مسجد روضه محمدیه را بر عهده داشت و به دلیل تخصص بالایی که در تنظیم اسناد شرعیه داشت، در این زمینه هم مورد وثوق مردم بود. محمد نوجوان، در سن هفت سالگی پدر و در سن ۹ سالگی، مادرش را از دست داد و تحت سرپرستی پسرعموی خود میرزا محمد کرمانشاهی قرار گرفت. تحصیلات قدیم را تا حد لمعه و قوانین در مدرسه عبدالرحیمخان فراگرفت و در سال ۱۳۴۸ﻫ. ق، برای ادامه تحصیل به اصفهان و مدرسه چهارباغ رفت. در سال ۱۳۴۹ﻫ. ق همراه خانواده به قم رفت و ۲۱ سال آنجا اقامت کرد و رابطه وی با آیتالله حاج شیخ عبدالکریم حائری یزدی مؤسس حوزه علمیه قم تا بدان پایه صمیمی شد که گرفتاریهای طلاب را به اطلاع وی میرساند و کمک میگرفت. در سال ۱۳۵۵ﻫ. ق و پس از درگذشت آیتالله حائری، فشار رضاخان بر حوزههای علمیه و روحانیون فزونی گرفت و آیات عظام صدر، خوانساری و حجت، سرپرستی حوزه را مشترکاً به عهده داشتند. در این مقطع، آیتالله بروجردی در بیمارستان فیروزآبادی بستری شدند و برخی از علما و مدرسین حوزه قم تصمیم گرفتند ایشان را به قم دعوت کنند. از جمله این افراد، شهید آیتالله صدوقی بود که به اتفاق داماد آیتالله صدر به بیمارستان رفت و همراه با آیتالله بروجردی به قم بازگشت.
آشنایی شهید صدوقی با امام خمینی، در سال ۱۳۴۹ﻫ. ق و چند روز پس از ورود به قم اتفاق افتاد و چندی نگذشت که این آشنایی عمیقتر شد، آنگونه که وقتی امام به ایشان توصیه کرد برای تبلیغ دین به یزد برود، تردید به خود راه نداد!
در سال ۱۳۴۱ﻫ. ش و در ماجرای انجمنهای ایالتی و ولایتی، مدیریت جلسات روحانیت و تلگراف زدن به علمای شهرهای مختلف در مورد این لایحه، زیر نظر شهید صدوقی بود و در نتیجه تلاش امام و همراهی علمایی، چون وی، بالاخره شاه ناچار شد این لایحه را لغو کند. در ۱۵ خرداد ۴۲، شهید صدوقی مجلسی بزرگ در مسجد ملااسماعیل یزد برگزار کرد که جمعیتی فوقالعاده در آن شرکت کردند. پس از دستگیری امام، شهید صدوقی یکی از علمایی بود که با شجاعت به تهران رفت تا با کمک علمای سایر بلاد، موجبات آزادی امام را فراهم آورد. پس از آزادی امام، همراه ایشان به قم رفت و چند روزی در این شهر اقامت کرد و سپس عازم مکه شد. در طول مبارزات نهضت اسلامی، یکی از افرادی که به تمامی در خدمت این حرکت درآمد و به دلیل محبوبیت فوقالعاده در یزد و سایر استانها و نیز هوشمندی و قدرت مدیریتی بالا، ساواک هرگز نتوانست به او تعرض جدی کند، شهید صدوقی بود. ایشان در ماجرای حریق سینما رکس آبادان نخستین کسی بود که اعلامیه داد و گناه این فاجعه را مستقیماً به گردن رژیم شاه انداخت! اعلامیههای امام از نجف و پاریس، مستقیماً برای دفتر شهید صدوقی خوانده میشد و به دستور ایشان، تکثیر و انتشار مییافت. پس از ورود امام خمینی به پاریس به دیدار ایشان رفت و ۱۲ روز آنجا اقامت کرد و با ایشان در زمینه مسائل مختلف، جلسات گفتگو داشت.
پس از پیروزی انقلاب اسلامی، وی از نخستین افرادی بود که در برابر رویکردهای نادرست دولت موقت و نیز ابوالحسن بنیصدر، موضعگیری کرد و افشاگریهای وی، تأثیر زیادی در عزل بنیصدر داشت. در پی برقراری نماز جمعهها به فرمان امام خمینی، امامت جمعه یزد به عهده ایشان قرار گرفت. شهید صدوقی به دلیل تأثیرگذاری فراوان در انقلاب و نظام اسلامی، بهشدت مورد خشم دشمنان انقلاب بود و سرانجام نیز در ماه رمضان ۱۳۶۰ﻫ. ش، در نماز جمعه مورد حمله یکی از منافقین قرار گرفت و در سن ۷۵ سالگی به شهادت رسید.
