بعد از امتناع وزير خارجه تركيه از حضور در بخش خاورميانه كنفرانس امنيتي مونيخ به دليل حضور صهيونيستها، وزير خارجه رژيم صهيونيستي با انتقاد از نخست وزير اين رژيم، عذرخواهي از تركيه بابت ماجراي كشتي مرمره را اشتباهي بزرگ خواند.
به نوشته روزنامه «هاآرتص»، آويگدور ليبرمن در بيانيهاي در اين باره گفت: «تصميم تركيه بار ديگر ثابت كرد عذرخواهي از تركيه بابت حادثه كشتي مرمره در سال 2010 اشتباه بزرگي بوده است». نتانياهو در مارس 2013 تلفني با «رجب طيب اردوغان» نخست وزير وقت تركيه گفتوگو كرد و بابت كشته شدن فعالان ترك در اثر حمله نظاميان صهيونيستي به كشتي مرمره كه حامل كمكهاي بشردوستانه براي مردم غزه بود، عذرخواهي كرد. ليبرمن افزود: «تا زماني كه تركيه تحت حكومت رجب طيب اردوغان است، شانس ترميم روابط اين كشور با اسرائيل وجود ندارد. تركيه در دوران اردوغان، كشوري است كه تنها مايل است به اسرائيل حمله و آن را تحريك كند. اسرائيل بايد همينگونه رفتار و از منافع خود حمايت كند.» «يووال اشتاينيتز» وزير اطلاعات رژيم صهيونيستي نيز به رفتار «مولود چاووش اوغلو» وزير خارجه تركيه واكنش نشان داد و در بيانيهاي ضمن انتقاد از تصميم تركيه گفت: «اسرائيل در همه كنفرانسهاي بينالمللي حضور مييابد چه تركيه دوست داشته باشد يا نداشته باشد.» وزير خارجه تركيه كه براي شركت در كنفرانس امنيتي بينالمللي به برلين رفته، در اعتراض به حضور صهيونيستها در اين كنفرانس از حضور در آن انصراف داد. چاووشاوغلو كه در يك نشست خبري مشترك با سفير تركيه در نهادهاي اروپايي شركت كرده بود، در اين خصوص گفت: «من ميخواستم در اين كنفرانس شركت كنم ولي پس از آنكه در آخرين لحظات، مقامات اسرائيلي به نشست خاورميانه آن اضافه شدند، تصميم بر آن شد كه ديگر در كنفرانس امنيتي مونيخ شركت نكنيم.» كارشناسان معتقدند آنكارا به شكلي عوامفريبانه با كاهش روابط ديپلماتيك خود با تلآويو در عين ادامه روابط پنهاني اطلاعاتي- امنيتي طرفين در چارچوب پيمان ناتو و زير نظر امريكاييها، اميدوار است بخشي از نيروهاي اسلامگراي منطقه را به سمت خود جذب كند و اجازه پيوستن گروههاي سني به محور مقاومت ايران، حزبالله و سوريه را ندهد.