زرگر آبان ماه ۱۳۹۹ جایگزین غضنفرآبادی در سمت ریاست دادگاه انقلاب اسلامی تهران شده بود. مرکز رسانه قوه قضائیه در این باره اعلام کرده است:حجت‌الاسلام سید احمد زرگر، قاضی باسابقه و رئیس دادگاه انقلاب اسلامی تهران، دارفانی را وداع گفت. این قاضی باسابقه و خوشنام دادگستری، به دلیل ابتلا به بیماری کرونا مدتی در بیمارستان خاتم‌الانبیای تهران بستری بود. آن مرحوم از مبارزان دوران رژیم ستمشاهی بود که بعد از پیروزی انقلاب اسلامی در جهت گسترش عدالت و دفاع از حقوق مردم ردای قضاوت بر تن کرد و در طول سال‌ها حضور در دستگاه قضا و مسئولیت‌هایی که بر عهده داشت، همواره در مسیر انقلاب ثابت قدم بود. قاضی زرگر در آبان ماه سال گذشته جانشین حجت‌الاسلام غضنفرآبادی در سمت ریاست دادگاه انقلاب اسلامی تهران شده بود. وی همچنین ریاست شعبه ۳۶ تجدیدنظر دادگاه انقلاب تهران و شعبه دوم دادگاه ویژه رسیدگی به جرائم اخلالگران و مفاسد اقتصادی را برعهده داشت. قاضی زرگر در دوران طولانی حضور در منصب خطیر قضاوت، پرونده‌های مهمی را مورد رسیدگی و صدور رأی قرار داد. قاضی زرگر در ۲۰ اردیبهشت سال ۵۸ با حکم حضرت امام خمینی (ره)، حاکم شرع در زمینه مبارزه با مواد مخدر تهران شد و در سال ۶۰ به سرپرستی دادسرای مبارزه با مواد مخدر تهران منصوب گشت. این قاضی باسابقه طی سال‌های ۷۰ تا ۷۲ جانشین دبیر ستاد مبارزه با مواد مخدر کل کشور نیز بود. قاضی زرگر همچنین از سال ۷۳ تا ۹۷ دبیری ستاد امر به معروف و نهی از منکر را برعهده داشت و یکی از مهم‌ترین دستاورد‌های وی در این سمت تلاش برای تصویب قانون حمایت از آمران معروف و ناهیان از منکر بود. قاطعیت، شجاعت، تسلط بر امر قضا از صفات بارز این قاضی برجسته بود.
رئیس‌جمهور در پیامی با تسلیت درگذشت حجت الاسلام سید احمد زرگر، رئیس فقید دادگاه انقلاب اسلامی اظهار داشت: این چهره متعهد، سرشناس و پر تلاش، سالیان متمادی از عمر شریف خود را در مناصب مختلف قضایی و نظارتی با اخلاص وقف خدمت به اسلام و انقلاب و به ویژه ارتقای ارزش‌های والای فرهنگی و عدالت محور نظام کرد.
رئیس قوه قضائیه نیز در پیامی درگذشت حجت‌الاسلام سید احمد زرگر را تسلیت گفت. در بخشی از پیام حجت‌الاسلام محسنی اژه‌ای آمده است: قاطعیت، شجاعت و تلاش مخلصانه و دلسوزانه برای اصلاح و تعالی جامعه از صفات بارز این قاضی برجسته بود.
