حضرت آیت الله خامنهای به جایگاه تأثیرگذار مرحوم
حاج سیدمصطفی خمینی در حادثه مهم دستگیری امام(ره) در سال 42 اشاره کردند و
افزودند: آن مرحوم در آن زمان با حضور در صحن حرم حضرت معصومه سلام الله
علیها و گرد آمدن مبارزین در کنار ایشان، کار بزرگ و شجاعانهای انجام داد و
توانست حرکت مردم را هدایت کند.
رهبر انقلاب اسلامی، درگذشت مرموز و بهت آور مرحوم حاج سیدمصطفی خمینی در
اول آبان سال 1356 را نیز، زمینه ساز ایجاد موج مردمی بیان کردند و گفتند:
نحوه مواجهه امام(ره) با این فقدان سنگین که آن را از الطاف خفیه الهی
دانستند، بخشی از شخصیت عظیم امام بزرگوار را در تحمل این مصیبت، و صبر بر
آن نشان داد.
حضرت آیت الله خامنهای با اشاره به تهذیب نفس و گرایش سلوکی مرحوم حاج سید
مصطفی خمینی و ساده زیستی و زهد ایشان، خاطرنشان کردند: آن مرحوم با اینکه
فرزندِ شخصیت و مرجع بزرگی همچون امام خمینی(ره) بود اما ذرهای از
نشانههای آقازادگی در وی نبود.
ایشان افزودند: مرحوم حاج سیدمصطفی خمینی بهشدت علاقمند و عاشق امام بود و کوچکترین تعرض به شخصیت امام را بر نمی تابید.
پیش از سخنان رهبر انقلاب اسلامی، حجت الاسلام و المسلمین رشاد رئیس شورای
سیاستگذاری همایش بزرگداشت مرحوم آیت الله حاج سیدمصطفی خمینی و آقای حمید
انصاری دبیر همایش، گزارشی از برنامههای کنگره بزرگداشت مرحوم آیت الله
حاج سیدمصطفی خمینی و اقدامات انجامشده بیان کردند.