كانديداي پوششي گرچه براي دفاع از دولت ثبت‌نام كرده، اما مايه اختلاف شده است. هنوز معلوم نيست حسن روحاني خود با اين ثبت‌نام موافق بوده يا آنكه به دليل ترديد در داشتن پايگاه اجتماعي مستقل از اصلاح‌طلبان، مجبور شده تسليم نظر اصلاح‌طلبان شود.
عبدالرضا هاشم زايي، عضو فراكسيون اميد مي‌گويد كه «اصلاح‌طلبان به اين نتيجه رسيدند كه دو يا سه كانديدا در انتخابات داشته باشند، چه آقاي روحاني موافق باشند چه نباشند.» در واقع تصميم اصلاح‌طلبان گرفته شده بوده و موافقت و مخالفت حسن روحاني تأثيري در آن نداشته است. هاشم زايي تلویحاً مي‌گويد كه ممكن است روحاني كانديداي نهايي نباشد: «اگر در نظرسنجي‌ها كانديدايي رأيي بالاتر از آقاي روحاني داشته باشد، اصلاح‌طلبان بايد همان كانديدا را به عنوان نامزد نهايي خود معرفي كنند.»
در عين حال محمود صادقي سخنانش را در گفت‌و‌گو با تسنيم تكذيب كرد اما فايل صوتي آن منتشر شد كه نشان مي‌دهد اين اختلاف پررنگ است. اين نماينده اصلاح‌طلب مجلس با اشاره به كناره‌گيري جهانگيري به نفع روحاني از صحنه انتخابات، اظهار داشت: كنار رفتن جهانگيري به نفع روحاني به شرايط و فضاي انتخابات بستگي دارد.
پيش از اين، الياس حضرتي، ديگر عضو فراكسيون اميد مجلس در روزنامه اعتماد نوشته بود: «حضور اسحاق جهانگيري در ميدان رقابت در نگاه اول اين تفسير را در ذهن بر مي‌انگيزد كه تاكتيك انتخاباتي حسن روحاني است اما واقعيت آنجاست كه اين تاكتيك زاييده ذهن اصلاح‌طلبان بوده است. در اين ميان زمزمه‌هايي به گوش مي‌رسد كه رئيس‌جمهور موافق نبوده است؛ موضوعي كه بي‌شك امروز ارزش چنداني ندارد، چرا كه اگر اين موضوع هم صحت داشته باشد در هر صورت حسن روحاني به حاميان اصلاح‌طلب خود اعتماد كرد و تسليم تاكتيك انتخاباتي آنها شد.»
